Nació el 23 de agosto de 1828 en Ixhuatlan Veracruz.

Se graduó de Ingeniero Civil en la Universidad Nacional Autónoma de México a los veinticinco años. Creador de la Tridilosa, material que revolucionó la ingeniería. También incursionó en el mundo de la pintura, y con bastante éxito en la literatura. Sin embargo la política fue su mundo.

Defensor de la democracia, la libertad de expresión, en los años sesenta se convirtió en uno de los líderes sociales más importantes en México. A raíz del movimiento estudiantil en 1968, Heberto fue encarcelado durante cinco años en la prisión de Lecumberry.

Esta experiencia en lugar de desmoralizarlo, le dio una fuerza espiritual extraordinaria. Según sus propias palabras comprobó que podía aguantar el aislamiento, la tortura, que estaba listo para luchar siempre. Al salir de la cárcel convencido de su misión en la vida, buscó al célebre líder obrero, Demetrio Vallejo con quien fundó el Partido Mexicano de los Trabajadores. A Pesar de las presiones, traiciones, persecuciones, siguió adelante fortaleciéndose, preparándose, enseñando.

Constituido en una personalidad política en 1988 se lanzó como candidato presidencial del Partido Mexicano Socialista. Posteriormente declino en favor de Cuahtémoc Cárdenas. A raíz de las fraudulentas elecciones de ese año, junto con otros políticos e intelectuales, fundó el Partido de la Revolución Democrática, Instituto del que fue senador, candidato a gobernador de Veracruz y parte de la dirigencia nacional.

Heberto Castillo falleció en Ciudad de México el 6 de abril de 1997, a los 68 años de edad, víctima de un infarto de Miocardio.